Edu‎ > ‎Start‎ > ‎Примеры‎ > ‎

Пример 3

Результат выполнения зачетного задания Start по теме: 

«Проблемы изолированной перфузии печени и методы их решения» 

Выполнил магистр первого курса Калачев А.А.

 Ключевые слова: 

  1.  Изолированная перфузия - Isolated perfusion (биофизика)
  2. Печень – Liver (биология)
  3. Глюконеогенез – gluconeogenesis (биология)
  4. Потребление кислорода - oxygen consumption (биология)
  5. Поверхностное дыхание органа - shallow breathing organ (биология)
  6.  Лактат натрия - Sodium lactate (биология)
  7.  Центрифугирование – centrifugation (физика)
  8.  Раствор Кребса-Хенселейта - solution of Krebs-Henseleyt (биология)
  9.  Гипоксия – hypoxia (биология)
  10.  Воздействие хлоридом кобальта - Effects of cobalt chloride (биология)
  11.  Детоксикация – detoxification (биология)
  12.  Гомеостаз – homeostasis (физика)
  13. Поддержание температуры при перфузии - Maintain temperature during perfusion (физика)
  14. ИФА (иммуноферментный анализ) -  immunosorbent assay (физика)
  15. Наночастицы – Nanoparticles (нано)

    Поиск по ключевым словам

1)     http://pubs.acs.org/

2)     http://www.sciencedirect.com/

3)     http://scholar.google.com/

4)     http://elibrary.ru/

5)     http://www.springerlink.com/

6)     http://publish.aps.org/

7)     http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

 Основные журналы [9-17]:

  Наибольшее количество статей по всем ключевым словам во всех базах данных в журнале [9]

После непродолжительного поиска в базе данных http://scholar.google.com/ обнаружил журнал «perfusion» [17]. Также нашел форум, посвященный перфузии http://www.perfusion.com/ , и хотя там, в основном, обсуждаются проблемы перфузии сердца, полезную информацию для себя я сумел найти.

Комментарии к статьям и книгам. Для ознакомления с методом перфузии, для понимания сути проблемы просто необходимо прочесть книги В.П. Нефедова [1,2]. Это человек, который внес огромный вклад в развитие этой области. При его руководстве и непосредственном участии был создан «Гомеостат 3-М» - установка для замкнутой перфузии, аналогов которой в мире нет.

Комментарии к статьям по теме моей работы:

В статье [3] исследуется влияние порядка 950 различных веществ на печень. В перечень этих веществ входит и хлорид кобальта.

Cтатья [4] не совсем относится к теме моей работы, просто заинтересовали способы проверки и полученные результаты. Правильный поиск в Scholar Google по «Assuncao M. Red Wine Protects against Ethanol-Induced Oxidative Stress in Rat Liver» позволил найти ещё одну статью [18] на эту тему.

Работа [5] представляет для меня огромный интерес, чтобы изучать глюконеогенез. Моя курсовая работа во многом пересекается со статьёй [5].

Сайт, указанный мною в ссылке [9], считаю лучшим поисковиком по журналам, и нахожу его лучше, чем указание прямых ссылок на журналы, так как он дает более широкий обзор. И не у всех журналов есть персональные страницы.

 Ответы на вопросы:

1.                      Состояние проблемы в мире. Исследования идут довольно интенсивно.  Однако перфузия стала вспомогательным инструментом во многих областях медицины и биологии. К сожалению, приостановились исследования в фундаментальной области. Я так и не смог найти ни одной статьи об изучении явления поверхностного дыхания печени во время длительной перфузии. Этот эффект впервые наблюдали в Красноярске в Институте биофизики СО РАН [1,2].

2.                      Место моей задачи в общей проблеме. С трудом могу адекватно оценить свое место в общей теме, потому что, как и любой увлекающийся человек, люблю свое занятие. Если попытаться исходить из объективных оценок, то подобной работы еще не было – подбор пороговых концентраций хлорида кобальта, рассмотрение его влияния при малых концентрациях (возможно, наблюдение положительного эффекта для метаболизма печени) и при концентрации близкой к летальной (оценка жизнеспособности и функционирования печени в токсичных условиях). Плюс к этому, будет вводиться в раствор Кребса-Хенселейта лактат натрия, который будет усиливать глюконеогенез, что было показано в моей курсовой работе за 3й курс. Ввиду этих обстоятельств очень интересными представляются статьи [4] и [6].

3.                      Какие открытия произошли в моей области? Сложно сказать, что именно в перфузии произошли открытия. Скорее она поспособствовала многим открытиям в трансплантологии, лечении онкологических заболеваний, применению новых лекарств и так далее.

4.                      Вывод о проделанной работе. Еще после первого выполнения этого задания год назад, я понял, что доказать что-то своё и то, что ты сделал что-то новое, можно только понимая формулировку проблемы в мире и собственное место в этой проблеме. Для этого знание научной литературы по проблеме обязательно.

Из замечаний рецензента для примера http://ecodevo.molpit.ru/edu/primery/sample2

1) Чтобы лучше понять проблему, и себя в этой проблеме, сделайте анализ сайтов

http://en.wikipedia.org/wiki/Perfusion

http://en.wikipedia.org/wiki/Perfusionist

http://perfusion-ua.blogspot.com/

и содержание последнего выпуска журнала [17] http://prf.sagepub.com/content/current и по годам http://prf.sagepub.com/content/by/year

2) Описание журналов [9-17], которые Вы скопировали с журнальных сайтов, надо было сделать на русском языке.

3) Надо было указать, у каких журналов нет персональных страниц – что достаточно странно для меня. Сейчас это достаточно редко встречается.

Список использованных источников

1.      Нефедов В.П. Механизмы гомеостаза в изолированных системах и организме / В.П. Нефедов. – Красноярск,1984 – 232с.

2.      Нефедов В.П., Самойлов В.А., Гареев Р.А., Ким Т.Д. Управление функциональной активностью органов при перфузии / В.П. Нефедов, В.А. Самойлов, Р.А Горяев, Т.Д. Ким. – Новосибирск: Наука, 1981. – 205с

3.      Fourches D. Cheminformatics Analysis of Assertions Mined from Literature That Describe Drug-Induced Liver Injury in Different Species / Denis Fourches, Julie C. Barnes, Nicola C. Day, Paul Bradley, Jane Z. Reed and Alexander Tropsha. // Chem. Res. Toxicol., 2010, 23 (1), pp 171–183 DOI: 10.1021/tx900326k

4.      Assuncao M. Red Wine Protects against Ethanol-Induced Oxidative Stress in Rat Liver / Marco Assunhttp://pubs.acs.org/entityImage/?text=0063,0327http://pubs.acs.org/entityImage/?text=0061,0303o, Maria J. Santos-Marques, Roshttp://pubs.acs.org/entityImage/?text=0061,0301rio Monteiro, Isabel Azevedo, Joshttp://pubs.acs.org/entityImage/?text=0065,0301 P. Andrade, Fhttp://pubs.acs.org/entityImage/?text=0065,0301lix Carvalho and Maria J. Martins. // J. Agric. Food Chem., 2009, 57 (14), pp 6066–6073 DOI: 10.1021/jf900576h

5.      Sakai A. Monochloroacetic Acid Inhibits Liver Gluconeogenesis by Inactivating Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase / Akiko Sakai, Hiroyasu Shimizu, Koichi Kono, and Eisuke Furuya. // Chem. Res. Toxicol., 2005, 18 (2), pp 277–282 DOI: 10.1021/tx0497705

6.      Laurent S. Pharmacokinetics and Biodistribution of Nanoparticles / Sophie Laurent, Delphine Forge, Marc Port, Alain Roch, Caroline Robic, Luce Vander Elst and Robert N. Muller. // Chem. Rev., 2008, 108 (6), pp 2064–2110 DOI: 10.1021/cr068445e

7.      Espina B. Impact of the Pectenotoxin C-43 Oxidation Degree on Its Cytotoxic Effect on Rat Hepatocytes / Begohttp://pubs.acs.org/entityImage/?text=006e,0303a Espihttp://pubs.acs.org/entityImage/?text=006e,0303a, M. Carmen Louzao, Isabel R. Ares, Eva S. Fonfrhttp://pubs.acs.org/entityImage/?text=0069,0301a, Natalia Vilarihttp://pubs.acs.org/entityImage/?text=006e,0303o, Mercedes R. Vieytes, Takeshi Yasumoto and Luis M. Botana. // Chem. Res. Toxicol., 2010, 23 (3), pp 504-515. DOI: 10.1021/tx9002337

8.      Yang A.-J. Activation of the cAMP/CREB/Inducible cAMP Early Repressor Pathway Suppresses Andrographolide-Induced Gene Expression of the π Class of Glutathione S-Transferase in Rat Primary Hepatocytes / Ai-Jen Yang, Chien-Chun Li, Chia-Yang Lu, Kai-Li Liu, Chia-Wen Tsai, Chong-Kuei Lii and Haw-Wen Chen. // J. Agric. Food Chem., 2010, 58 (3), pp 1993-2000. DOI: 10.1021/jf902221j  DOI: 10.1021/jf902221j.

9.      Biochemistry. Найти публикациями можно на сайте http://pubs.acs.org/journal/bichaw  Biochemistry is a peer-reviewed academic journal in the field of biochemistry. Founded in 1962, the journal is published weekly by the American Chemical Society, with 51 annual issues. The journal's 2008 impact factor was 3.379, and it received a total of 94,645 citations in 2008.

10.  J. Medical Chemistry. Journal of Medicinal Chemistry is the most-cited journal in Medicinal Chemistry with 49,474 total citations in 2009 and an Impact Factor of 4.802, ranking it also as the #1 primary research journal in impact in the category as reported in the 2009 Journal Citation Reports® by Thomson Reuters. На вэб сайте, указанном в пункте выше, вы можете посмотреть интересующие вас публикации из этого журнала.

11.  Chemical Research in Toxicology publishes Articles, Reviews, Perspectives, Communications and Chemical Profiles. Features entitled Forum and Letters to the Editor are also published periodically. The Journal is intended to provide a venue for presentation of research relevant to all aspects of the chemical basis of toxic responses. CRT recorded an increase in ISI Impact Factor in 2009 to 3.740 with 8,959 total citations

12.  Journal of  Proteome Research. JPR publishes original peer-reviewed research Articles, Letters, Reviews, Perspectives, Communications and Technical Notes. In addition, the journal provides Research Profiles about papers published in the journal; Meeting News from proteomics meetings; Government and Society News for the proteomics community; Proteomics Projects, updated progress on large proteomics endeavors; a Calendar of upcoming proteomics conferences and meetings; and Online News about current research published outside of the journal, bioinformatics tools, and other data resources. Indexed by ISI in Biochemical Research Methods, the Journal of Proteome Research recorded an ISI Impact Factor of 5.132 and 10,352 citations as reported in the 2009 Journal Citations Reports

13.  Analytical Chemistry reported 82,246 total citations, a 5.7% increase, ranking it #1 in total citations out of 70 journals in the Analytical Chemistry category. The journal also has a high ISI Impact Factor of 5.214 as reported by the 2009 Journal Citation Report

14.  Journal of the American Chemical Society, founded in 1879, is the flagship journal of the American Chemical Society and the preeminent journal in the field. This periodical is devoted to the publication of fundamental research papers in all areas of chemistry and publishes approximately 16,000 pages of Articles, Communications, Book Reviews, and Computer Software Reviews a year. Published weekly, JACS provides research essential to the field of chemistry. The most cited journal in chemistry, the Journal of the American Chemical Society (JACS) received 351,813 total citations and an increase in ISI Impact Factor to 8.580, while publishing more articles (3,332) than any other journal in the category as reported in the 2009 Journal Citation Reports® by Thomson Reuters.

15.  Molecular Pharmaceutics publishes the results of original research that contributes significantly to the molecular mechanistic understanding of drug delivery and drug delivery systems. The journal encourages contributions describing research at the interface of drug discovery and drug development. Indexed by ISI in Pharmacology & Pharmacy, Molecular Pharmaceutics recorded an ISI Impact Factor of 5.408 with 2,117 total citations as reported in the 2009 Journal Citation Reports® by Thomson Reuters. The journal now ranks in the top 20 journals in ISI Impact Factor (#16) among the 236 journals in the Pharmacology & Pharmacy category.

16.  Journal of Agricultural and Food Chemistry. Out of 44 journals in the Agriculture, Multidisciplinary category, Journal of Agricultural and Food Chemistry is the #1 journal in total citations (56,340),  #2 in ISI® Impact Factor (2.469), and #1 articles published (1,588). Journal of Agricultural and Food Chemistry is also the #1 ranked journal in total citations in Applied Chemistry and Food Science and Technology. 

17.  Perfusion. Impact Factor: 0.642. Ranked: 54 out of 60 in Peripheral Vascular Disease. Журнал выходит с 1986 года January 1986 - January 2011. Сейчас том 26 № 1. Вэб сайт журнала http://prf.sagepub.com/.  Perfusion provides current information on all aspects of perfusion, oxygenation and biocompatibility and their use in modern cardiac surgery. The journal is at the forefront of international research and development and presents an appropriately multidisciplinary approach to perfusion science. Perfusion's reputation for the highest quality research is further enhanced by collaborative ventures.

18.  Assuncao M. Red wine antioxidants protect hippocampal neurons against ethanol-induced damage: A biochemical, morphological and behavioral study / M. Assunção, M.J. Santos-Marques, V. de Freitas, F. Carvalho, J.P. Andrade, N.V. Lukoyanov and M.M. Paula-Barbosa. // Neuroscience, Volume 146, Issue 4, 8 June 2007, Pages 1581-1592. doi:10.1016/j.neuroscience.2007.03.040

 

Comments